自2007年1月1日起，公路、內(nèi)河貨物運(yùn)輸業(yè)發(fā)票稅控系統(tǒng)已在全國范圍內(nèi)推行。目前，認(rèn)證發(fā)現(xiàn)涉嫌違規(guī)公路、內(nèi)河貨物運(yùn)輸業(yè)發(fā)票（以下簡稱貨運(yùn)發(fā)票）有“認(rèn)證不符”、“密文有誤”和“重復(fù)認(rèn)證”等類型，稽核發(fā)現(xiàn)涉嫌違規(guī)貨運(yùn)發(fā)票有“比對不符”、“缺聯(lián)”和“重號”等類型。為進(jìn)一步加強(qiáng)公路、內(nèi)河貨物運(yùn)輸業(yè)發(fā)票稅控系統(tǒng)開具貨運(yùn)發(fā)票的增值稅抵扣管理，現(xiàn)將認(rèn)證、稽核發(fā)現(xiàn)的涉嫌違規(guī)貨運(yùn)發(fā)票處理有關(guān)問題通知如下：

　　一、屬于“認(rèn)證不符”中“納稅人識別號認(rèn)證不符（發(fā)票所列受票方納稅人識別號與申報(bào)認(rèn)證企業(yè)的納稅人識別號不符）”、“發(fā)票代碼號碼認(rèn)證不符（機(jī)打代碼或號碼與發(fā)票代碼或號碼不符）”的貨運(yùn)發(fā)票，不得作為增值稅進(jìn)項(xiàng)稅額抵扣憑證。稅務(wù)機(jī)關(guān)應(yīng)將貨運(yùn)發(fā)票原件退還企業(yè)，并告知其認(rèn)證發(fā)現(xiàn)的問題類型，企業(yè)應(yīng)要求開票方重新開具。

　　二、屬于“重復(fù)認(rèn)證”、“密文有誤”和“認(rèn)證不符（不包括發(fā)票代碼號碼認(rèn)證不符和納稅人識別號認(rèn)證不符）”的貨運(yùn)發(fā)票，暫不得作為增值稅進(jìn)項(xiàng)稅額抵扣憑證，稅務(wù)機(jī)關(guān)應(yīng)扣留原件，移送稽查部門作為案源進(jìn)行查處。屬于稽核發(fā)現(xiàn)涉嫌違規(guī)的貨運(yùn)發(fā)票，暫不得作為增值稅進(jìn)項(xiàng)稅額抵扣憑證，由管理部門按照審核檢查的有關(guān)規(guī)定進(jìn)行核查和處理。

　　經(jīng)稽查部門檢查或管理部門審核檢查確認(rèn)屬于稅務(wù)機(jī)關(guān)操作問題以及技術(shù)性問題造成的，允許作為增值稅進(jìn)項(xiàng)稅額抵扣憑證；不屬于稅務(wù)機(jī)關(guān)操作問題以及技術(shù)性問題造成的，不得作為增值稅進(jìn)項(xiàng)稅額抵扣憑證。屬于國稅機(jī)關(guān)操作問題及技術(shù)性問題的，分別由誤操作的相關(guān)部門或技術(shù)主管部門核實(shí)后，由區(qū)縣稅務(wù)機(jī)關(guān)出具書面證明；屬于地稅機(jī)關(guān)操作問題及技術(shù)性問題的，分別由誤操作的相關(guān)部門或技術(shù)主管部門核實(shí)后，由區(qū)縣地稅機(jī)關(guān)按照有關(guān)規(guī)定回函，同時出具書面證明。

　　三、有關(guān)問題的說明

　　重復(fù)認(rèn)證，是指已經(jīng)認(rèn)證相符的同一張貨運(yùn)發(fā)票再次認(rèn)證。

　　密文有誤，是指貨運(yùn)發(fā)票所列密文無法解譯。

　　認(rèn)證不符，是指納稅人識別號有誤，或者貨運(yùn)發(fā)票所列密文解譯后與明文不一致。

　　比對不符，是指貨運(yùn)發(fā)票抵扣聯(lián)與存根聯(lián)數(shù)據(jù)的開票日期、承運(yùn)人納稅人識別號、受票人納稅人識別號、運(yùn)費(fèi)金額四要素存在不同。不符的優(yōu)先級次順序?yàn)椋哼\(yùn)費(fèi)金額、承運(yùn)人受票人雙方納稅人識別號、受票人納稅人識別號、承運(yùn)人納稅人識別號、開票日期。

　　缺聯(lián)，是指貨運(yùn)發(fā)票稽核系統(tǒng)內(nèi)有抵扣聯(lián)而無對應(yīng)存根聯(lián)并且按規(guī)定不需留待下期繼續(xù)比對。

　　重號，是指貨運(yùn)發(fā)票稽核系統(tǒng)內(nèi)存在兩份或者兩份以上相同發(fā)票代碼和號碼的抵扣聯(lián)。